23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1445 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1445  excision promoter, Xis  100 
 
 		 89 aa  187  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  72 
 
 		 67 aa  84  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3570  excisionase/Xis, DNA-binding  49.21 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  44.44 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1293  regulatory protein MerR  47.06 
 
 		 59 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0603  excisionase/Xis, DNA-binding protein  50 
 
 		 58 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0923  hypothetical protein  54 
 
 		 62 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  48.98 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2294  hypothetical protein  52 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  44.23 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5292  hypothetical protein  40.35 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6363  hypothetical protein  46.94 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1800  hypothetical protein  46.48 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  43.14 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  40.38 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  39.13 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  31.03 
 
 		 251 aa  42.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  45.65 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0545  DNA binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00223675  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0563  PTS system, IIA component  45.45 
 
 		 223 aa  40.8  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.11237  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>