44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2925 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4449  hypothetical protein  57.81 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219666  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  54.69 
 
 
65 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  54.69 
 
 
65 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  52.54 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  59.62 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  48.21 
 
 
70 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  53.06 
 
 
77 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  53.85 
 
 
80 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  53.06 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  48.08 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  47.17 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3886  hypothetical protein  51.85 
 
 
69 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0561  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 
59 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0914  hypothetical protein  37.7 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  42.22 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1445  excision promoter, Xis  39.13 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  35.19 
 
 
58 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3570  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  39.34 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  41.27 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  46.94 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  31.03 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3852  hypothetical protein  36.73 
 
 
280 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  42.19 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5292  hypothetical protein  39.22 
 
 
69 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1284  hypothetical protein  40 
 
 
66 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0195028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  41.82 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 
73 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0824  hypothetical protein  37.25 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00274141  hitchhiker  0.0000530792 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  42.22 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  33.33 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3111  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  33.33 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  42.86 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2294  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  32.26 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  46.81 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  41.94 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  42.19 
 
 
93 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0915  regulatory protein MerR  34 
 
 
89 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>