69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0015 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  100 
 
 		 75 aa  150  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  76.47 
 
 		 77 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  74.29 
 
 		 77 aa  98.6  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  77.42 
 
 		 70 aa  97.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  85.19 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  53.7 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  56 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  56 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0561  DNA binding domain-containing protein  52 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  48.21 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  47.17 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  39.24 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4449  hypothetical protein  48 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  43.94 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  42.86 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  44.23 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  46 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  46.94 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  46.55 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  46.55 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  46.94 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  38.98 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  38.89 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  46.43 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  40.38 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  44.07 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5292  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  38.1 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0603  excisionase/Xis, DNA-binding protein  45.1 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0824  hypothetical protein  44.68 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00274141  hitchhiker  0.0000530792 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  42.62 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  42.62 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3570  excisionase/Xis, DNA-binding  39.22 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  40.62 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  36.07 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  46 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  47.92 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  47.92 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  47.92 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  45.1 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  47.92 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  43.1 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 		 93 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 93 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3886  hypothetical protein  43.18 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0732  hypothetical protein  42.31 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3111  hypothetical protein  41.07 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3843  hypothetical protein  40.74 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  42 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1284  hypothetical protein  37.04 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0195028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  45.83 
 
 		 89 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  38.71 
 
 		 73 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>