51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3521 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 70 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  77.42 
 
 		 75 aa  97.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  83.33 
 
 		 77 aa  93.6  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  81.13 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  75 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  53.57 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0561  DNA binding domain-containing protein  52.63 
 
 		 59 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  53.57 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  46.27 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  47.46 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  48.21 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4449  hypothetical protein  48.21 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  48.15 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  43.55 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  45 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  44.44 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3886  hypothetical protein  48.72 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  52.08 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  37.1 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5292  hypothetical protein  37.29 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3570  excisionase/Xis, DNA-binding  34.92 
 
 		 65 aa  43.9  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1445  excision promoter, Xis  33.33 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  40.35 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0824  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00274141  hitchhiker  0.0000530792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  38.57 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  41.54 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  43.86 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16860  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  34.85 
 
 		 67 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  44.44 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  45.83 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  44.9 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  35.59 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  44.44 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0603  excisionase/Xis, DNA-binding protein  41.18 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  44.9 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  44.9 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  42.59 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  40 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3843  hypothetical protein  36.67 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  44.44 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  44.44 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  44.44 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  44.44 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0732  hypothetical protein  42.31 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  42.59 
 
 		 108 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>