26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0732 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0732  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7467  hypothetical protein  72.06 
 
 
76 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3843  hypothetical protein  72.31 
 
 
75 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329718  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  66.18 
 
 
76 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  47.17 
 
 
69 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  43.18 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  45.83 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  34.92 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  44.74 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  42.31 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  41.07 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  41.82 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  41.07 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  42.59 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  43.64 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  41.18 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  54.29 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  42.59 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  35.94 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  42.31 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>