42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2980 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  158  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3843  hypothetical protein  78.87 
 
 		 75 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0732  hypothetical protein  66.18 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7467  hypothetical protein  56 
 
 		 76 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  52.73 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  46.81 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  38.1 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  48.72 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  48 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  38.57 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  38.57 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  38.57 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  49.02 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  38.57 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  40.35 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  38.57 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  38.57 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  37.14 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  46.81 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  39.66 
 
 		 251 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  41.07 
 
 		 87 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  37.14 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  37.14 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  37.14 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  36.21 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  44.68 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  45.1 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  37.7 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0824  hypothetical protein  43.18 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00274141  hitchhiker  0.0000530792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  44.9 
 
 		 93 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  44.9 
 
 		 93 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 93 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  44.9 
 
 		 93 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>