35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3238 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  180  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  70 
 
 		 87 aa  117  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  51.61 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  46.43 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2797  hypothetical protein  48.21 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000554604  hitchhiker  0.00000544866 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1138  hypothetical protein  45.45 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  45.45 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  45.61 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  43.86 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  37.29 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  44.07 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  39.29 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  42.31 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  41.07 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0833  hypothetical protein  41.51 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  41.27 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  37.25 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  35.71 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  41.07 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  35.71 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  39.39 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  42.86 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  40.38 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16860  hypothetical protein  36.17 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  37.7 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0732  hypothetical protein  35.94 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3843  hypothetical protein  38.78 
 
 		 75 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>