16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0833 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0833  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  197  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  50.88 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  49.12 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1138  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2797  hypothetical protein  44.44 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000554604  hitchhiker  0.00000544866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  46.43 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1943  hypothetical protein  53.85 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.605997  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  39.13 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16860  hypothetical protein  49.02 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  36.84 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  41.51 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  46.81 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  55.88 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0732  hypothetical protein  33.82 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>