20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2797 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2797  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  147  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000554604  hitchhiker  0.00000544866 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1138  hypothetical protein  61.9 
 
 		 70 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  61.9 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  59.09 
 
 		 70 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  67.8 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  49.18 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0833  hypothetical protein  51.11 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  50.85 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  47.46 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  48.21 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1038  hypothetical protein  39.58 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.140038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  54.35 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  48.89 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16860  hypothetical protein  44.68 
 
 		 74 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1943  hypothetical protein  42 
 
 		 65 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.605997  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  39.29 
 
 		 68 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0824  hypothetical protein  46.15 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00274141  hitchhiker  0.0000530792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1885  hypothetical protein  44.44 
 
 		 109 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>