28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2785 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2797  hypothetical protein  67.8 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000554604  hitchhiker  0.00000544866 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1138  hypothetical protein  56.9 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  56.9 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  54.24 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  54.39 
 
 		 69 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1943  hypothetical protein  49.23 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.605997  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  48.28 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0833  hypothetical protein  48.94 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16860  hypothetical protein  46.15 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  37.29 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  41.82 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  43.1 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  41.82 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1229  phage transcriptional regulator, AlpA  43.55 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470338  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  46.81 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  45.28 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0195028  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  39.66 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  45.24 
 
 		 73 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  58.06 
 
 		 69 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  45.45 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  43.48 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  36.54 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0517  DNA binding domain protein, excisionase family  38.46 
 
 		 207 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  44.68 
 
 		 90 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>