24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2640 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  70 
 
 		 87 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  52.24 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  50.91 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2797  hypothetical protein  47.46 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000554604  hitchhiker  0.00000544866 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  39.44 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1138  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  43.64 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  53.19 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  41.82 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  46 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  47.06 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0833  hypothetical protein  40.74 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  44 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  34.85 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16860  hypothetical protein  40.32 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0732  hypothetical protein  44.74 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3843  hypothetical protein  40.82 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  42 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  40.38 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  38.18 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>