46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3222 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  140  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  54.55 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  51.72 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  48.28 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1138  hypothetical protein  48.28 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2797  hypothetical protein  50.85 
 
 		 71 aa  57  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000554604  hitchhiker  0.00000544866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  42.19 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  44.83 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  43.1 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  43.1 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  43.1 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  43.1 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  43.1 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16860  hypothetical protein  47.06 
 
 		 74 aa  50.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  45.61 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  39.39 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  53.19 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  43.1 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  44.68 
 
 		 87 aa  48.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  41.38 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  45.45 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  39.66 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  43.1 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  41.38 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  41.38 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  41.38 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  41.82 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  39.66 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  43.75 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  46.67 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  39.66 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0833  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  37.93 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  37.93 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  37.93 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  37.93 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  37.93 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  44.07 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  38.98 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  36.21 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  40.35 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  40.35 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3496  DNA binding domain protein, excisionase family  45.24 
 
 		 76 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  54.29 
 
 		 80 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>