65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3369 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  76.81 
 
 		 80 aa  110  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  61.04 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  66.67 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  55.68 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  67.8 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  60.87 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  65.22 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  52.56 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  68.33 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  66.67 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  68.33 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  68.33 
 
 		 93 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  55.56 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  63.24 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  66.67 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  66.67 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  61.67 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  56.52 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  60.29 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  56.52 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  63.33 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  63.33 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  66.1 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  61.54 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  62.71 
 
 		 252 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  63.33 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  60 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  48.84 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  52.78 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  55.07 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  52.17 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  50.85 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  47.62 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  52.54 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  52.54 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  50.85 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  52.54 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  49.15 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  52.54 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  49.15 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  49.15 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  50.85 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  50.85 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  50.85 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  52.54 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  49.15 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  50.85 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  50.85 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  48.28 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  48.28 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  51.72 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  35.37 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  42.62 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1229  phage transcriptional regulator, AlpA  39.34 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470338  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  48 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  43.75 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  36.23 
 
 		 81 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  40.35 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  42.31 
 
 		 87 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>