60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1245 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  191  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  37.8 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  48.28 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  48.28 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  40.91 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  48.28 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  48.28 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  38.96 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  46.55 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  35.62 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  44.83 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  34.15 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3496  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  40.32 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  36.25 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 93 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3852  hypothetical protein  54.55 
 
 		 280 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  36.99 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  38.24 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  38.24 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  38.24 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  38.24 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  38.24 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  41.67 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  36.51 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  40.58 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  37.31 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  39.66 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  35.37 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  39.02 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  35.37 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  36.92 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  42.25 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  42.31 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  38.98 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  39.66 
 
 		 252 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  39.66 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  36.49 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  33.33 
 
 		 94 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0277  DNA binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.830937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  31.43 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  38.18 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  40.82 
 
 		 77 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>