70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1035 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  100 
 
 		 94 aa  189  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  66.67 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  65.43 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  63.41 
 
 		 96 aa  103  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  73.61 
 
 		 80 aa  103  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  58.51 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  60.26 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  58.06 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  55.29 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  59.74 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  60.47 
 
 		 93 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  62.82 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  54.84 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  60 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  66.67 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  53.33 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  53.19 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  59.76 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  59.76 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  54.95 
 
 		 93 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  55.81 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  52.69 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  60.49 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  58.67 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  55.06 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  60.56 
 
 		 252 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  54.65 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  67.74 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  57.33 
 
 		 86 aa  87  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  57.75 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  59.02 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  60 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  60 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  46.74 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  63.16 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  49.28 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  55 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  46.88 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  51.72 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  47.46 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  45.9 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  47.54 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  47.54 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  47.54 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  45.9 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  47.54 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  45.9 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  47.46 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  45.9 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  45.76 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  47.46 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  44.26 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  45.76 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  44.26 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  45.76 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  44.83 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  44.83 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  40.32 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  36.07 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  44.68 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1229  phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470338  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  31.88 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  46.81 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2703  DNA binding domain protein, excisionase family  33.85 
 
 		 149 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  38.64 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>