77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1484 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  89.81 
 
 		 108 aa  200  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  90.82 
 
 		 98 aa  184  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  83.81 
 
 		 105 aa  181  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  92.47 
 
 		 93 aa  176  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  91.4 
 
 		 93 aa  175  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  89.25 
 
 		 93 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  89.25 
 
 		 93 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  88.17 
 
 		 93 aa  169  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  83.02 
 
 		 106 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  81.32 
 
 		 94 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  80.22 
 
 		 91 aa  150  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  74.49 
 
 		 98 aa  148  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  80.65 
 
 		 100 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  83.33 
 
 		 94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  83.1 
 
 		 94 aa  129  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  82.86 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  82.86 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  81.69 
 
 		 89 aa  127  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  68.66 
 
 		 77 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  55.88 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  54.67 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  65 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  58.46 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  59.68 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  59.38 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  51.35 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  52.94 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  58.06 
 
 		 93 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  51.35 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  54.55 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  54.55 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  58.06 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  51.39 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  52.94 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  58.62 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  50.72 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  55.22 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  58.06 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  56.92 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  51.56 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  54.84 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  52.17 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  54.84 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  54.84 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  53.33 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  52.46 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  54.1 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  52.54 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  45.95 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  52.54 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  50.82 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  45.31 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  45.59 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  47.54 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  50.88 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  48.28 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  52 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  42.03 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  44.83 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  45.71 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  43.75 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  43.4 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3496  DNA binding domain protein, excisionase family  47.17 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  38.98 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3852  hypothetical protein  40.35 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  34.67 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  42.11 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  50 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  39.06 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  42.59 
 
 		 70 aa  40  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1284  hypothetical protein  48.72 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0195028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  45.1 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4319  hypothetical protein  38.03 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  35.71 
 
 		 76 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>