79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2607 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  183  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  183  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  95.6 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  92.55 
 
 		 94 aa  173  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  83.52 
 
 		 93 aa  154  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  98.67 
 
 		 94 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  82.61 
 
 		 93 aa  153  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  82.42 
 
 		 98 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  82.42 
 
 		 108 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  98.65 
 
 		 94 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  82.42 
 
 		 93 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  82.42 
 
 		 93 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  82.42 
 
 		 105 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  82.42 
 
 		 93 aa  150  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  97.3 
 
 		 89 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  78.95 
 
 		 100 aa  140  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  69.79 
 
 		 98 aa  136  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  84.51 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  83.1 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  66.67 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  55.71 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  58.33 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  59.38 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  52.94 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  54.79 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  55.07 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  58.06 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  58.06 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  51.28 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  52.78 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  52.78 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  52.05 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  47.56 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  56.45 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  50.68 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  52.78 
 
 		 93 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  52.94 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  50.77 
 
 		 252 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  54.84 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  52.86 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  51.35 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  53.42 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  49.28 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  48.57 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  53.23 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  51.67 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  49.15 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  49.15 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  47.46 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  48.33 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  50.82 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  49.18 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  44.26 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  45.9 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  49.12 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  54 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  37.66 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  45.28 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  42.86 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  46.43 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3852  hypothetical protein  44.44 
 
 		 280 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  37.93 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  48 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3496  DNA binding domain protein, excisionase family  41.82 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  41.38 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  38.57 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  51.92 
 
 		 69 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  37.1 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0914  hypothetical protein  37.88 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3843  hypothetical protein  34.72 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0732  hypothetical protein  41.07 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0069  hypothetical protein  39.68 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  33.9 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>