63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4016 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  186  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  88.37 
 
 		 92 aa  157  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  79.57 
 
 		 93 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  79.57 
 
 		 93 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  79.57 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  87.5 
 
 		 93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  86.25 
 
 		 93 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  76.34 
 
 		 93 aa  141  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  72.04 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  72.04 
 
 		 93 aa  130  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  73.17 
 
 		 93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  81.82 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  78.75 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  80.25 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  77.63 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  72.5 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  77.46 
 
 		 252 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  73.68 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  73.61 
 
 		 92 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  74.65 
 
 		 97 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  68.35 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  70.27 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  70.42 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  66.67 
 
 		 88 aa  97.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  62.07 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  70.83 
 
 		 80 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  63.89 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  60.49 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  61.97 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  60.56 
 
 		 83 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  63.38 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  66.67 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  66.67 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  63.33 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  58.46 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  57.58 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  56.06 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  54.29 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  54.84 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  56.06 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  56.06 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  56.06 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  56.06 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  56.06 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  56.06 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  58.33 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  53.03 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  56.67 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  53.03 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  55 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  55 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  55 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  55 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  54.24 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  54.24 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  53.45 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  36.99 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  38.71 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  39.29 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  35.82 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  34.38 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>