27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1419 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  224  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1138  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  146  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  77.94 
 
 		 70 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2797  hypothetical protein  61.9 
 
 		 71 aa  87  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000554604  hitchhiker  0.00000544866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  49.28 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  56.9 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  48.28 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0833  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  47.27 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  39.44 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  45.45 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16860  hypothetical protein  38.1 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  36.84 
 
 		 69 aa  48.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  45.45 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1943  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  43.5  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.605997  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  35.94 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  47.73 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1038  hypothetical protein  30.61 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.140038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  34.38 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  34.38 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  33.87 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  37.5 
 
 		 92 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 93 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>