77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2797 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  66.2 
 
 		 93 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  65.71 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  61.43 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  65.15 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  62.32 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  61.43 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  60.56 
 
 		 93 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  57.75 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  58.57 
 
 		 92 aa  90.1  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  59.15 
 
 		 93 aa  90.1  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  60.56 
 
 		 93 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  60.56 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  55.56 
 
 		 93 aa  89.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  64.06 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  57.75 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  57.75 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  61.19 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  66.67 
 
 		 96 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  57.75 
 
 		 93 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  67.16 
 
 		 93 aa  87.8  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  63.93 
 
 		 252 aa  87.8  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 		 97 aa  87  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 		 80 aa  87  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  67.8 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  67.8 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  55.07 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  60.87 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  57.14 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  61.9 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  60.32 
 
 		 87 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  57.97 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  55.71 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  55.71 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  55.71 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  55.71 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  55.88 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  55.07 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  55.07 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  53.62 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  56.92 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  55.88 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  54.29 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  55.88 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  54.41 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  54.41 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  52.86 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  54.41 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  52.05 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  54.41 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  54.41 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  56.25 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  56.25 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  49.28 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  56.45 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  55.74 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  46.15 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  43.55 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  39.39 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  42.65 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  42.31 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  36.23 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  39.62 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  39.66 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2955  hypothetical protein  36.51 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1885  hypothetical protein  42.11 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  39.34 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1038  hypothetical protein  40.38 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.140038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  43.1 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  40.38 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  36.21 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3852  hypothetical protein  38.78 
 
 		 280 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  32.89 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0732  hypothetical protein  54.29 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  33.87 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>