68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2867 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  86.17 
 
 		 96 aa  159  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  82.43 
 
 		 94 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  85.92 
 
 		 93 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  66 
 
 		 100 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  64.13 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  79.45 
 
 		 91 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  78.38 
 
 		 93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  75 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  77.14 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  75.71 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  76.71 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  68.29 
 
 		 93 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  68.35 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  73.24 
 
 		 80 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  65.82 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  68.92 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  70.83 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  72.6 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  68.35 
 
 		 93 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  70.42 
 
 		 93 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  74.65 
 
 		 93 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  73.24 
 
 		 93 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  71.83 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  71.83 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  68.83 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  67.65 
 
 		 252 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  65.79 
 
 		 98 aa  100  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  62.82 
 
 		 94 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  64.29 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  55.91 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  62.32 
 
 		 80 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  66.67 
 
 		 83 aa  87  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  66.67 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  66.67 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  54.17 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  48.75 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  52 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  59.65 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  54.55 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  52.94 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  50.67 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  50.67 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  52 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  52.05 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  52.94 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  50.68 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  50.67 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  50.67 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  50.67 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  53.03 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  53.03 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  53.03 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  49.33 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  52.31 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  52.31 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  53.45 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  44.62 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  47.92 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  41.07 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  46.3 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2703  DNA binding domain protein, excisionase family  34.18 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  37.68 
 
 		 73 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  44 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1229  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470338  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3852  hypothetical protein  44.44 
 
 		 280 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>