65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0365 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  78.38 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  78.57 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  60.42 
 
 		 100 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  76.06 
 
 		 80 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  67.07 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  72.6 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  75.71 
 
 		 97 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  69.01 
 
 		 94 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  62.5 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  71.23 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  69.33 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  67.53 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  71.05 
 
 		 93 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  54.44 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  65 
 
 		 93 aa  98.6  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  67.14 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  69.86 
 
 		 93 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  70.42 
 
 		 93 aa  97.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  63.29 
 
 		 92 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  69.01 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  69.01 
 
 		 93 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  62.86 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  66.2 
 
 		 93 aa  94.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  55.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  53.33 
 
 		 94 aa  94.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  66.2 
 
 		 93 aa  94.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  56.82 
 
 		 93 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  62.86 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  61.04 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  61.04 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  62.86 
 
 		 252 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  65.22 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  68.33 
 
 		 80 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  61.9 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  63.16 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  49.32 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  50.68 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  56.52 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  52.94 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  49.32 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  51.47 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  49.32 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  52.94 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  49.32 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  52.94 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  48.61 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  48.61 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  51.47 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  51.47 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  51.47 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  58.62 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  46.58 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  38.71 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  51.02 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  41.82 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  38.18 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1885  hypothetical protein  48.94 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  44.68 
 
 		 66 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>