67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1513 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  189  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  79.57 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  74.19 
 
 		 93 aa  140  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  74.19 
 
 		 93 aa  140  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  80.23 
 
 		 93 aa  139  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  78.41 
 
 		 93 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  77.91 
 
 		 93 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  76.47 
 
 		 92 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  70.97 
 
 		 93 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  68.82 
 
 		 93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  70.97 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  75.58 
 
 		 91 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  77.78 
 
 		 93 aa  123  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  75.95 
 
 		 93 aa  120  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  76.06 
 
 		 252 aa  113  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  78.08 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  72 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  70.89 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  67.5 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  68.35 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  65.43 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  65.38 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  65 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  68.06 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  54.84 
 
 		 94 aa  96.7  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  69.44 
 
 		 80 aa  94.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  62.16 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  64.79 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  55.84 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  61.19 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  64.79 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  55.56 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  55.56 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  65 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  59.02 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  47.73 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  54.84 
 
 		 93 aa  72  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  53.23 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  54.84 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  53.23 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  53.23 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  53.23 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  48.57 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  53.23 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  53.23 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  53.23 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  53.23 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  55 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  53.33 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  53.33 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  53.33 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  53.33 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  57.89 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  53.33 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  52.54 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  52.54 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  37.8 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  53.45 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  43.55 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  38.71 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  36.11 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3852  hypothetical protein  34.69 
 
 		 280 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  44.19 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  42 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  36.51 
 
 		 70 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>