22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3852 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3852  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  54.55 
 
 		 94 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1284  hypothetical protein  42.55 
 
 		 66 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0195028  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  43.48 
 
 		 80 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  47.73 
 
 		 100 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  30.77 
 
 		 77 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  38.78 
 
 		 93 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 93 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 93 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  43.18 
 
 		 94 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  36.73 
 
 		 66 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  47.5 
 
 		 93 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  42.22 
 
 		 89 aa  42.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  34.72 
 
 		 95 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  42.22 
 
 		 94 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  32.08 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  42.22 
 
 		 94 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  34.69 
 
 		 93 aa  42  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  32.2 
 
 		 77 aa  42  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>