72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3530 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 93 aa  187  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  187  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  83.87 
 
 		 93 aa  154  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  81.72 
 
 		 93 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  79.57 
 
 		 93 aa  149  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  79.57 
 
 		 93 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  77.42 
 
 		 92 aa  143  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  77.42 
 
 		 93 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  74.19 
 
 		 93 aa  140  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  72.04 
 
 		 93 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  76.34 
 
 		 93 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  74.44 
 
 		 91 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  68.82 
 
 		 93 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  75.31 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  72.73 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  67.9 
 
 		 100 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  68.75 
 
 		 96 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  73.24 
 
 		 252 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  72.22 
 
 		 92 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  71.83 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  62.96 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  65.79 
 
 		 80 aa  96.7  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  64 
 
 		 87 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  60.71 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  59.76 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  66.2 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  63.51 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  64.79 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  54.22 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  57.75 
 
 		 83 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  58.57 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  63.33 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  63.33 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  63.33 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  52.86 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  58.46 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  56.06 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  56.92 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  50.72 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  52.78 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  60 
 
 		 100 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  55.38 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  55.38 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  55.38 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  55.38 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  55.38 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  55.38 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  55.38 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  54.84 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  55 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  55 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  55 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  55 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  54.24 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  54.24 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  53.33 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  35.62 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  38.71 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  36.67 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  39.68 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3852  hypothetical protein  38.78 
 
 		 280 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  47.92 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  44.07 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0732  hypothetical protein  34.92 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  40.62 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  39.29 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  44.44 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  42.86 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  34.38 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  44.9 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  34.38 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>