74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3183 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  100 
 
 
93 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  79.57 
 
 
93 aa  149  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  79.57 
 
 
93 aa  149  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  86.21 
 
 
93 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  82.95 
 
 
93 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  76.34 
 
 
93 aa  141  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  77.42 
 
 
93 aa  140  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  80.23 
 
 
93 aa  139  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  73.12 
 
 
93 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  82.56 
 
 
91 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  83.33 
 
 
92 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  76.74 
 
 
93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  83.78 
 
 
93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  77.78 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  70.73 
 
 
100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  76 
 
 
94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  68.29 
 
 
92 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  71.79 
 
 
96 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  68.42 
 
 
252 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  68.29 
 
 
97 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  71.05 
 
 
90 aa  100  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  70.83 
 
 
80 aa  98.2  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  62.5 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  63.29 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  57.47 
 
 
87 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  64.1 
 
 
88 aa  94.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  63.89 
 
 
89 aa  94.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  54.65 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  58.75 
 
 
86 aa  90.5  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  59.15 
 
 
83 aa  90.1  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  56 
 
 
98 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  65.22 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  65.22 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  60.87 
 
 
80 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  58.33 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  58.57 
 
 
77 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  53.23 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  50.67 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  54.84 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  54.43 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  54.84 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  50.68 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  50.7 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  50.7 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  50.7 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  53.23 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  53.23 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  53.23 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  53.23 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  53.23 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  53.23 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  55 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  55 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  53.33 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  56.9 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  46.03 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  38.71 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  34.78 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  41.82 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0732  hypothetical protein  41.67 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  36.99 
 
 
75 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 
77 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3852  hypothetical protein  36.73 
 
 
280 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  41.18 
 
 
73 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  41.07 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1138  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1229  phage transcriptional regulator, AlpA  37.1 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470338  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  38.64 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  42.19 
 
 
66 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>