64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2495 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 80 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  79.17 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  74.65 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  72.97 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  76.06 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  74.65 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  71.83 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  70.83 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  73.24 
 
 		 97 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  69.44 
 
 		 100 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  73.61 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  71.62 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  70.83 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  68.06 
 
 		 87 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  66.2 
 
 		 89 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  70.83 
 
 		 93 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  69.44 
 
 		 93 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  63.89 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  65.79 
 
 		 93 aa  96.7  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  65.79 
 
 		 93 aa  96.7  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  70.83 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  68.06 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  68.06 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  66.2 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  69.44 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  67.14 
 
 		 252 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  66.18 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  62.5 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  66.67 
 
 		 80 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  66.67 
 
 		 83 aa  87  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  68.33 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  68.33 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  52.05 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  51.39 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  63.16 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  49.3 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  51.39 
 
 		 93 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  48.61 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  48.61 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  51.52 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  51.47 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  53.23 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  49.23 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  49.23 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  46.97 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  58.62 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  42.37 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  51.06 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  41.27 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  38.1 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  38.71 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  40 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>