29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3230 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  179  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  51.61 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0250995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  52.24 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  47.37 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  48.28 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1138  hypothetical protein  47.27 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1419  hypothetical protein  47.27 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.28498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2797  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000554604  hitchhiker  0.00000544866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  43.64 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  42.31 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  44.68 
 
 		 67 aa  48.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0833  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1885  hypothetical protein  55 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  36.23 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16860  hypothetical protein  31.94 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  32 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  36.21 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  36.21 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  35.48 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  36.21 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  36.21 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  33.9 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3843  hypothetical protein  44.68 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  30.67 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 110 aa  40  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>