21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3843 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3843  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  155  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329718  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  78.87 
 
 
76 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0732  hypothetical protein  72.31 
 
 
73 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7467  hypothetical protein  63.01 
 
 
76 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  53.06 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  35.21 
 
 
89 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  35.21 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  34.72 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2640  hypothetical protein  40.82 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  40.74 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  34.72 
 
 
91 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3230  hypothetical protein  44.68 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.210946  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  36.62 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  36.67 
 
 
70 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  35.71 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  35.71 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  40.74 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  40.82 
 
 
251 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3238  hypothetical protein  38.78 
 
 
87 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0250995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>