49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1678 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  167  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  43.66 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  40.85 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  40.85 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  40.85 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  39.44 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  39.44 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  39.44 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  39.44 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  39.44 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  45 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0914  hypothetical protein  38.89 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  41.67 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  40.98 
 
 		 73 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  41.67 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  36.92 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  39.44 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  43.14 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  35 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  36.21 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  36.92 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  39.34 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  42.19 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  37.31 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4319  hypothetical protein  37.31 
 
 		 170 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  36.23 
 
 		 89 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2816  hypothetical protein  33.85 
 
 		 72 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.316842  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  36.23 
 
 		 89 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  36.11 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  35.82 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0917  hypothetical protein  34.43 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.378157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2456  hypothetical protein  36.21 
 
 		 167 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  34.43 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>