26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0914 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0914  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  38.89 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0824  hypothetical protein  36.21 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00274141  hitchhiker  0.0000530792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  37.7 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  38.03 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0603  excisionase/Xis, DNA-binding protein  38.46 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  37.88 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  37.7 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  37.88 
 
 		 94 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  36.07 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  37.88 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  36.07 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  36.07 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  36.07 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  37.88 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  37.88 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  33.77 
 
 		 108 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  33.77 
 
 		 98 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  31.51 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  34.43 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  36.36 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  36.36 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  37.25 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  32.31 
 
 		 81 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  34.92 
 
 		 83 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>