42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7051 on replicon NC_010374
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  76.36 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  48.08 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  46.15 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  54.9 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1284  hypothetical protein  37.5 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0195028  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4319  hypothetical protein  48.08 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  41.38 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  38.71 
 
 
65 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  38.71 
 
 
65 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1885  hypothetical protein  41.1 
 
 
109 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  52.38 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  43.14 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  38.98 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4449  hypothetical protein  37.1 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219666  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  36.21 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  51.22 
 
 
58 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  44.19 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1229  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470338  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  42.31 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1909  hypothetical protein  31.51 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1072  hypothetical protein  32.88 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  40.32 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3886  hypothetical protein  44.68 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  45.83 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  40.62 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  48.84 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  39.22 
 
 
251 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  37.84 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  40 
 
 
252 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  33.33 
 
 
66 aa  41.2  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  38.46 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  38.24 
 
 
91 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  34.57 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5292  hypothetical protein  38.78 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  32.89 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3111  hypothetical protein  40.38 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  46.81 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0069  hypothetical protein  33.8 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>