13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3886 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3886  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  46.38 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  51.85 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4449  hypothetical protein  53.49 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  51.16 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  51.16 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  48.72 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  43.33 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  44.44 
 
 		 251 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  53.12 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  44.68 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  43.18 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>