190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2438 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2438  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 
291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5502  DNA binding domain-containing protein  75.26 
 
 
291 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2745  DNA binding domain-containing protein  46.76 
 
 
300 aa  251  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0333  DNA binding domain protein, excisionase family  40.14 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0048  DNA binding domain-containing protein  38.98 
 
 
296 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3033  excisionase/Xis, DNA-binding  38.64 
 
 
304 aa  178  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.627333  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0369  DNA binding domain-containing protein  36.24 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000403691  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0119  excisionase/Xis, DNA-binding  38.26 
 
 
309 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0629  periplasmic substrate-binding protein  38.68 
 
 
290 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0674  molybdate-binding domain-containing protein  35.45 
 
 
304 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.95042e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0194  DNA binding domain-containing protein  32.57 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.741486  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1908  excisionase/Xis, DNA-binding  33.33 
 
 
307 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1894  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  38.26 
 
 
640 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.116253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0447  molybdenum cofactor synthesis domain protein  36.84 
 
 
642 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.583292  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1453  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  37.39 
 
 
652 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1164  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  34.2 
 
 
655 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811833  hitchhiker  0.00369459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4144  DNA binding domain-containing protein  29.9 
 
 
301 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4820  DNA binding domain-containing protein  31.4 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2264  DNA binding domain protein, excisionase family  30.94 
 
 
328 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4502  hypothetical protein  31.4 
 
 
301 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0052  DNA binding domain-containing protein  31.42 
 
 
301 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3620  hypothetical protein  31.06 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0344  DNA binding domain-containing protein  31.06 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3713  DNA binding domain-containing protein  31.06 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.017295  normal  0.392744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3784  DNA binding domain-containing protein  30.72 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000134193  normal  0.867769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3909  DNA binding domain-containing protein  30.72 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007474  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3228  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  33.04 
 
 
666 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  28.99 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4428  DNA binding domain-containing protein  31.06 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0240  DNA binding domain protein, excisionase family  30.38 
 
 
301 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.256207  hitchhiker  0.000155098 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4217  DNA binding domain-containing protein  30.38 
 
 
301 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00203903  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4129  DNA binding domain-containing protein  30.38 
 
 
301 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000950861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4099  DNA binding domain-containing protein  30.38 
 
 
301 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2110  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  36.61 
 
 
649 aa  112  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0934426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0684  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  30.6 
 
 
648 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1861  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  34.82 
 
 
647 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.72567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0382  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  33.48 
 
 
650 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.690457  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1772  molybdenum cofactor synthesis domain protein  34.2 
 
 
649 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  25.16 
 
 
320 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1391  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  30.94 
 
 
635 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1797  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  32.59 
 
 
655 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.984095 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0881  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.48 
 
 
624 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.542033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  32.81 
 
 
377 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3717  DNA binding domain protein, excisionase family  31.97 
 
 
307 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.222458  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24590  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.76 
 
 
645 aa  102  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  25.23 
 
 
335 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1676  molybdenum cofactor synthesis domain protein  28.51 
 
 
633 aa  99.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0664  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  32.16 
 
 
621 aa  99.4  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.509419  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0985  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  31.27 
 
 
644 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.587268  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30 
 
 
639 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  32.45 
 
 
376 aa  95.9  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  23.23 
 
 
306 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  33.51 
 
 
377 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2870  molybdate metabolism transcriptional regulator  33.5 
 
 
372 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2878  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  34.5 
 
 
644 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  22.56 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  21.89 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0083  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  30.36 
 
 
655 aa  93.6  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.536917  normal  0.152284 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1821  putative molybdate-binding protein  28.52 
 
 
294 aa  92.8  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4308  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  38.83 
 
 
378 aa  92.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2363  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.94 
 
 
368 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0615  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  30.84 
 
 
651 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  22.7 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  21.64 
 
 
315 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01990  DNA-binding protein, excisionase family  25.73 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000725149  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1859  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  37.04 
 
 
639 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.693636 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.42 
 
 
368 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.42 
 
 
368 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0339  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.21 
 
 
358 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  22.22 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0843  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  34.55 
 
 
637 aa  89.4  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.505015  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3707  periplasmic-binding protein  33.33 
 
 
361 aa  89.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.775197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.87 
 
 
368 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0920  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  34.05 
 
 
644 aa  89  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0353995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  21.31 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  21.55 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  25.08 
 
 
317 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  30.85 
 
 
377 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0896  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.42 
 
 
365 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0910  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.38 
 
 
368 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527444  normal  0.0178578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1625  molybdate transport repressor  37.18 
 
 
368 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1757  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.03 
 
 
371 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0898  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.38 
 
 
368 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0405  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  31.58 
 
 
636 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  35.87 
 
 
345 aa  87  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  21.55 
 
 
306 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  21.55 
 
 
306 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0374  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  29.91 
 
 
632 aa  86.7  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.858069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0552  molybdate metabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 
373 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  21.55 
 
 
306 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4147  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.38 
 
 
368 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.70321  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0386  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.13 
 
 
362 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2477  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  33.5 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.497113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3016  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  31.31 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3130  molybdate metabolism transcriptional regulator  33.5 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  35.09 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0991  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  35.45 
 
 
637 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0710453 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1190  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  33.69 
 
 
638 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3787  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2967  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  32.98 
 
 
353 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>