47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0475 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0475  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 59 aa  117  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0173  DNA binding domain protein, excisionase family  49.09 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  47.46 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  46.3 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1536  DNA binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  51.16 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  51.16 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4535  DNA binding domain protein, excisionase family  37.29 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0643  DNA binding domain protein, excisionase family  39.29 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  39.13 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  41.3 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  33.96 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.59 
 
 		 306 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  42.59 
 
 		 315 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  42.59 
 
 		 315 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  44.19 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  39.13 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  53.19 
 
 		 306 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  35.85 
 
 		 78 aa  43.9  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  40.74 
 
 		 306 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  40.74 
 
 		 306 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  40.74 
 
 		 315 aa  43.9  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  40.74 
 
 		 306 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  30.91 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  52.38 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  34.78 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  39.13 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1185  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.161554  normal  0.167811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0830  DNA binding domain protein, excisionase family  44.19 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 305 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  36.96 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  36.96 
 
 		 112 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2946  hypothetical protein  48.72 
 
 		 130 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  40.91 
 
 		 308 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 320 aa  40.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  36.54 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  31.48 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 118 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>