18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0643 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0643  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 81 aa  158  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  60.38 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  60.38 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0173  DNA binding domain protein, excisionase family  40.28 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  53.33 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  56.6 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  54.72 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0475  DNA binding domain protein, excisionase family  39.29 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0262  hypothetical protein  43.33 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4535  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1536  DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1745  DNA binding domain protein, excisionase family  42.31 
 
 		 68 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  30.51 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  31.34 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2946  hypothetical protein  41.3 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1410  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  43.75 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.251698  normal  0.111999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1996  hypothetical protein  37.93 
 
 		 75 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.327621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>