23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4535 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4535  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 61 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  53.7 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2946  hypothetical protein  71.05 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  45.9 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  45 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0262  hypothetical protein  49.02 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0475  DNA binding domain protein, excisionase family  37.29 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  44.44 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1536  DNA binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0643  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0173  DNA binding domain protein, excisionase family  37.93 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  42.55 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4217  hypothetical protein  43.4 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  40.43 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1759  hypothetical protein  44.23 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  38.78 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3803  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0056722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  42.55 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  38 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1068  DNA binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 117 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0663  DNA binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 71 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.292535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>