16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0173 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0173  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 100 aa  196  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0475  DNA binding domain protein, excisionase family  49.09 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0643  DNA binding domain protein, excisionase family  40.28 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1536  DNA binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  47.46 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1759  hypothetical protein  44.44 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  42.62 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  52.5 
 
 		 64 aa  42.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2946  hypothetical protein  43.1 
 
 		 130 aa  42  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  42.31 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4535  DNA binding domain protein, excisionase family  37.93 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0262  hypothetical protein  35.48 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  33.33 
 
 		 306 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 67 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>