43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4091 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
151 aa  295  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3544  phage excisionase  72 
 
 
149 aa  201  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374064  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1508  DNA binding domain-containing protein  51.77 
 
 
140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000123588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  45.99 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  25 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  33.83 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  33.83 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  33.83 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  33.83 
 
 
165 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0363  hypothetical protein  43.75 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1346  MerR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
156 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000136372  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  38.46 
 
 
58 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0183  excisionase/Xis, DNA-binding  48 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.50459 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2684  excisionase/Xis, DNA-binding  42 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  33.33 
 
 
73 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  47.73 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1370  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2507  DNA binding domain protein, excisionase family  41.82 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.286901  normal  0.381075 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  42.86 
 
 
315 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  34.55 
 
 
216 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  35.71 
 
 
216 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  35.71 
 
 
244 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2944  DNA binding domain protein, excisionase family  46 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  6.70203e-60  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  27.84 
 
 
306 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  34.55 
 
 
216 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  34.55 
 
 
216 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  35.71 
 
 
216 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  34.55 
 
 
216 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0748  excisionase/Xis, DNA-binding  38.3 
 
 
104 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.613095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2049  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531029  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0343  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  44.9 
 
 
335 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2059  excisionase/Xis, DNA-binding  38.3 
 
 
105 aa  41.2  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  28.87 
 
 
315 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  44.9 
 
 
306 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  43.48 
 
 
248 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  44.9 
 
 
315 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  27.84 
 
 
306 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  29.9 
 
 
306 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  27.84 
 
 
306 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  27.84 
 
 
306 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  32.86 
 
 
305 aa  40.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  27.84 
 
 
315 aa  40.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>