18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1346 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1346  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  313  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000136372  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0363  hypothetical protein  37.75 
 
 		 147 aa  84.3  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  23.68 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1508  DNA binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000123588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  28.74 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  31.34 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  28.57 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  28.32 
 
 		 320 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  30 
 
 		 126 aa  43.9  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0085  DNA binding domain-containing protein  25.45 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0754203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  22.54 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  22.54 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3544  phage excisionase  22.31 
 
 		 149 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  22.54 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2133  DNA binding domain-containing protein  22.95 
 
 		 252 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  31.48 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  30.19 
 
 		 57 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  23.61 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>