23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1508 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1508  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  275  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000123588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3544  phage excisionase  54.68 
 
 		 149 aa  139  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  51.77 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  47.48 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  24.82 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  32.61 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  31.16 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0363  hypothetical protein  41.82 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1346  MerR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000136372  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1370  DNA binding domain protein, excisionase family  42.22 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2684  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0748  excisionase/Xis, DNA-binding  38.3 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.613095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2049  DNA binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  37.5 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2507  DNA binding domain protein, excisionase family  43.64 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.286901  normal  0.381075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2059  excisionase/Xis, DNA-binding  36.17 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0343  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  35.29 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  34.78 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  40.91 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0855  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0365807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>