20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3222 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3222  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  238  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4226  DNA binding domain-containing protein  44.3 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.89473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1068  DNA binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  56.76 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  52.94 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  56.41 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  57.89 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  52.94 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  55.26 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  56.76 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  53.85 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  62.86 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  55 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  49.02 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  58.82 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  43.9 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  54.05 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  52.5 
 
 		 67 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  52.5 
 
 		 67 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>