35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2463 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2463  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 74 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000388448  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  45.1 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1847  hypothetical protein  37.88 
 
 		 74 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.983219  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1359  hypothetical protein  43.55 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0880  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0183206  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1222  hypothetical protein  39.29 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.935548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0421  prophage LambdaBa04, DNA binding protein  38.89 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0435  prophage LambdaBa04, DNA binding protein  38.89 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000289269  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2623  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein, putative  36.36 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00448007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1985  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000030807  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  36.96 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  37.5 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  35.42 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2142  excisionase/Xis, DNA-binding  39.68 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.276898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  34.78 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 85 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  33.96 
 
 		 78 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  34.78 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  36.96 
 
 		 67 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  36.96 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18850  DNA-binding protein, excisionase family  42.55 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0755115 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0513  DNA binding domain-containing protein  28.07 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.252241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2727  DNA binding domain, excisionase family protein  36.54 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000622476  hitchhiker  0.000211315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  34.69 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  35.42 
 
 		 78 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2595  DNA binding domain, excisionase family protein  36.54 
 
 		 88 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 90 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 90 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>