62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1287 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 371 aa  760    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  48.28 
 
 		 370 aa  288  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  53.63 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  48.62 
 
 		 376 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42.7 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  45.74 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  45.35 
 
 		 369 aa  263  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  46.64 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  44.29 
 
 		 369 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  46.25 
 
 		 387 aa  255  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  43.93 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  43.57 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  45.97 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  44.27 
 
 		 360 aa  239  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  43.45 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  41.9 
 
 		 342 aa  232  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  38.74 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  41.5 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  39.56 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  43.03 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  39.13 
 
 		 353 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  39.13 
 
 		 371 aa  225  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.57 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  38.63 
 
 		 337 aa  222  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  39.92 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  39.92 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  39.92 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  36.88 
 
 		 380 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  39.53 
 
 		 346 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  39.53 
 
 		 346 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  41.09 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  38.34 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  37.72 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  39.76 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  38.74 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  38.74 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  36.31 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  37.27 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.9 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.16 
 
 		 360 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  32 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  28.66 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  28.62 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  29.17 
 
 		 433 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  32.1 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  31.96 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  29.47 
 
 		 351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  34.38 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  25.4 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  23.24 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  26.41 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  25.86 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  24.51 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.91 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  27.31 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  25.86 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  26.24 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  23.2 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  24 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2318  hypothetical protein  29.87 
 
 		 276 aa  43.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 		 206 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>