62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1817 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  809    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  73.7 
 
 		 376 aa  548  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  67.69 
 
 		 369 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  67.95 
 
 		 369 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  67.69 
 
 		 369 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  68.39 
 
 		 369 aa  508  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  66.58 
 
 		 376 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  47.3 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  49.61 
 
 		 375 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  51.6 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  45.92 
 
 		 368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  44.53 
 
 		 360 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  45.78 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  45.82 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  44.14 
 
 		 371 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  42.95 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  44.88 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  42.62 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  39.64 
 
 		 380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  45.35 
 
 		 340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  47.1 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  47.1 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  47.1 
 
 		 346 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  47.1 
 
 		 346 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  47.1 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  43.24 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  45.17 
 
 		 350 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  41.84 
 
 		 349 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  40.82 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  43.65 
 
 		 342 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  41.78 
 
 		 358 aa  226  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  38.62 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  39.69 
 
 		 388 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  38.76 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  38.76 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  36.03 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  37.89 
 
 		 353 aa  209  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.87 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  37.28 
 
 		 360 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.43 
 
 		 315 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  33.87 
 
 		 376 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  36.14 
 
 		 370 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  26.01 
 
 		 334 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  27.87 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  30.84 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  29.37 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  31.43 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  28.09 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  29.01 
 
 		 325 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  28.25 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  24.19 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  28.85 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  26.14 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  23.4 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  26.14 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  25.76 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  22.94 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  23.15 
 
 		 291 aa  57  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  22.86 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  24.34 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  32.39 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  21.17 
 
 		 372 aa  46.6  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>