69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2235 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  93.22 
 
 		 369 aa  634    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  100 
 
 		 369 aa  751    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  92.93 
 
 		 369 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  70.05 
 
 		 376 aa  504  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  73.08 
 
 		 376 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  67.98 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  63.09 
 
 		 369 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  50.56 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  48.91 
 
 		 375 aa  342  5.999999999999999e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  49.05 
 
 		 368 aa  342  8e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  53.12 
 
 		 363 aa  338  8e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  46.52 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  43.41 
 
 		 387 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  46.35 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  47.22 
 
 		 340 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  40 
 
 		 380 aa  266  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  44.72 
 
 		 337 aa  262  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  43.93 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  46.25 
 
 		 353 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  46.51 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  46.51 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  44.44 
 
 		 355 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  46.64 
 
 		 371 aa  258  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  45.74 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  46.51 
 
 		 346 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  46.12 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  46.12 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  43.55 
 
 		 349 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  44.44 
 
 		 342 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  45.06 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  41.67 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  41.67 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  42.47 
 
 		 388 aa  225  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.43 
 
 		 317 aa  222  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  41.38 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  41.8 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  37.11 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  33.23 
 
 		 356 aa  192  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  36.23 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  36.65 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  33.56 
 
 		 376 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  28.05 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  27.82 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  30.13 
 
 		 433 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  31.95 
 
 		 380 aa  126  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  30.63 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  29.39 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  30.59 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  29.13 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  27.63 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  28.91 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  27.63 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  27.34 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  25.29 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  23.85 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  23.38 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  21.64 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  19.9 
 
 		 291 aa  53.9  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  38.71 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0296  hypothetical protein  35.48 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542313  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4511  hypothetical protein  36.76 
 
 		 727 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0756  hypothetical protein  37.5 
 
 		 178 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1651  hypothetical protein  34.18 
 
 		 187 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  24.65 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3438  hypothetical protein  35.94 
 
 		 180 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  24.06 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3370  band 7 protein  22.8 
 
 		 306 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  25.47 
 
 		 387 aa  42.7  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>