64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6360 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  100 
 
 		 315 aa  647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  60.88 
 
 		 317 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  45.49 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  41.2 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  40.15 
 
 		 370 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  40.38 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  41.74 
 
 		 363 aa  225  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  42.98 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  35.54 
 
 		 344 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  35.86 
 
 		 353 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  34.2 
 
 		 355 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  35.99 
 
 		 349 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  40.08 
 
 		 342 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  35.28 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  35.37 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  33.72 
 
 		 353 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  34.73 
 
 		 346 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  38.84 
 
 		 376 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  33.63 
 
 		 349 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  32.73 
 
 		 337 aa  209  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  33.63 
 
 		 349 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  33.14 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  34.43 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  33.03 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  34.43 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  36.9 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  37.6 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.02 
 
 		 369 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  37.87 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  37.6 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  37.6 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  38.56 
 
 		 396 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  32.94 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  35.54 
 
 		 369 aa  196  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.25 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  33.6 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  32.76 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  175  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.68 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.68 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  30.66 
 
 		 376 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  30.08 
 
 		 370 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  34.08 
 
 		 433 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  30.77 
 
 		 351 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  28.57 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  25.09 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  24.16 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  34.5 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  24.9 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  30.17 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  29.43 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  29.59 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  29.82 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  22.5 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  21.53 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  27.64 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2318  hypothetical protein  27.71 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  23.22 
 
 		 403 aa  49.7  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  22.81 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  29.76 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  22.9 
 
 		 401 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  20.76 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0413  hypothetical protein  55.26 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2106  hypothetical protein  23.84 
 
 		 379 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0725633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>