21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2360 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  825    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  31.25 
 
 		 897 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0296  hypothetical protein  42.65 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542313  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2805  hypothetical protein  31.4 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0767963  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0077  hypothetical protein  41.51 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  45.16 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0961  hypothetical protein  41.94 
 
 		 193 aa  53.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.71 
 
 		 369 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  47.73 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.81 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3589  Fimbrial protein pilin  40 
 
 		 252 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3995  hypothetical protein  36.67 
 
 		 257 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00690793  normal  0.10342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  34.92 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1651  hypothetical protein  36.51 
 
 		 187 aa  47  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  37.1 
 
 		 369 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  37.1 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  46.67 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0181  RDD domain containing protein  23.08 
 
 		 288 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.210981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 727 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  32.14 
 
 		 376 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4468  MJ0042 family finger-like protein  43.9 
 
 		 590 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>