63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1481 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  842    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  55.1 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  56.63 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  32.76 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1615  hypothetical protein  31.45 
 
 		 413 aa  162  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0869  hypothetical protein  30.99 
 
 		 392 aa  160  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  31.93 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06420  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  31.48 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224562  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2106  hypothetical protein  29.78 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0725633 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  30.89 
 
 		 370 aa  153  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  33.1 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  25.42 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  25.13 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  25.46 
 
 		 358 aa  90.5  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  24.79 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  26.07 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  24.93 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.75 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  24.65 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  25.23 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  25 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  23.12 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  24.05 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  26.12 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  25.68 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  27.51 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  27.51 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  27.51 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  22.87 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  26.77 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  24.52 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  23.81 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  23.36 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  26.47 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  26.47 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  23.46 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  22.39 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  23.98 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  24.42 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  23.08 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  24.39 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  23.08 
 
 		 349 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  21.4 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  24 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  24 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  23 
 
 		 346 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  23.23 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  23.79 
 
 		 353 aa  53.9  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  24.69 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  24.69 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  24.34 
 
 		 337 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  22.84 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  27.42 
 
 		 360 aa  53.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  23.62 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  24.7 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  24.28 
 
 		 343 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  27.5 
 
 		 317 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  26.56 
 
 		 315 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  21.3 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1827  hypothetical protein  37.04 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09730  hypothetical protein  44.07 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.953034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0687  hypothetical protein  43.1 
 
 		 502 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  18.25 
 
 		 368 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>