112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2246 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  100 
 
 		 360 aa  729    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  92.22 
 
 		 356 aa  667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  41.34 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  39.39 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  36.87 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  34.93 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  36.69 
 
 		 388 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  37.76 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  40.78 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  41.83 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  37.65 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  37.35 
 
 		 376 aa  192  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.67 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  37.25 
 
 		 369 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  37.25 
 
 		 369 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  35.16 
 
 		 371 aa  185  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  35.32 
 
 		 369 aa  182  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  34.13 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  36.11 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  36.84 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  29.85 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  34.41 
 
 		 337 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  30.49 
 
 		 351 aa  179  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.53 
 
 		 317 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  36.81 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  36.71 
 
 		 346 aa  173  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  35.95 
 
 		 396 aa  172  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  35.27 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  34.52 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  36.11 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  36.14 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  29.72 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  34.13 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  33.8 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.38 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  27.08 
 
 		 380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  34.28 
 
 		 380 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  34.13 
 
 		 343 aa  149  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  33.73 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  33.73 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  32.14 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  32.14 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  31.75 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  31.35 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  31.35 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  31.35 
 
 		 350 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  30.56 
 
 		 325 aa  133  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  33.7 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  30.92 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  31.74 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  32.02 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  29.18 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  26.43 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  22.57 
 
 		 334 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  25.7 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  22.13 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  24.72 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  48.28 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  53.06 
 
 		 1149 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  23.32 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  52.08 
 
 		 1141 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  56.25 
 
 		 101 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  57.45 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  51.02 
 
 		 1151 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3047  FHA domain-containing protein  39.73 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  48.98 
 
 		 1151 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  46.94 
 
 		 680 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  50 
 
 		 1148 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2434  FHA domain-containing protein  36.99 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0872027  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4022  protein serine/threonine phosphatase  42.86 
 
 		 642 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0271  FHA domain containing protein  36.36 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.373949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0619  putative protein serine/threonine phosphatase  40.82 
 
 		 733 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163625  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  44.9 
 
 		 110 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  52.17 
 
 		 131 aa  53.9  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  52.27 
 
 		 1138 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  45.83 
 
 		 1139 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5969  hypothetical protein  48.21 
 
 		 100 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1752  hypothetical protein  48.21 
 
 		 100 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.298967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  45.83 
 
 		 91 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  40 
 
 		 505 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06650  hypothetical protein  37.11 
 
 		 402 aa  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1827  hypothetical protein  44.64 
 
 		 237 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2769  FHA domain-containing protein  36.62 
 
 		 526 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2031  zinc finger RanBP2-type  41.38 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  45.83 
 
 		 1291 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0026  putative protein serine/threonine phosphatase  38.78 
 
 		 651 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  35.37 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  45.83 
 
 		 1105 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2278  putative protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 		 669 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2329  putative protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 		 669 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.580462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0823  hypothetical protein  36.99 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0292128  normal  0.928575 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0586  hypothetical protein  42 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3116  FHA domain containing protein  37.7 
 
 		 383 aa  47  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0687  hypothetical protein  38.98 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0448  zinc finger, RanBP2-type  37.93 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4700  hypothetical protein  40 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1226  putative protein serine/threonine phosphatase  35.29 
 
 		 624 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.78 
 
 		 1080 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0115  hypothetical protein  45.65 
 
 		 127 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>